熱處理器幫助加快英國基因組分析速度

英格蘭諾威奇和聖達戈, 2015年10月28日 /美通社-PR Newswire/ -- 英國基因組分析中心(TGAC)的高效能計算(HPC)基礎設施將能獲益於加入Edico Genome的DRAGEN™，後者是全球首款被設計用來分析特定測序數據任務的處理器。DRAGEN將被用來加快TGAC的新一代測序工作流程。

對DRAGEN的初步評估表明，使用該處理器繪製白蠟樹基因組圖譜的每處理核心速度要比TGAC原有的HPC系統快177倍，處理最大的一個資料集只需7分鐘，而不是原先的3個小時。TGAC的HPC伺服器需要約2小時來完成的水稻基因組任務，使用DRAGEN就只需3分鐘便可完成。

TAGC科學計算部主管、專案組長Tim Stitt博士表示：「我們真的很高興成為Edico Genome的首位英國DRAGEN客戶，並且熱烈盼望利用這種開創性技術來推動達成我們的使命，即推動可持續生物經濟的發展，並確保英國的糧食安全。」

「尤其要指出的是，我們真的對DRAGEN如何處理小麥基因組感興趣，小麥基因組比人類基因組大四倍，也複雜得多。而小麥又是超過35%的全球人口的主食，現在預計，到2050年，全球人口將達到90億。」

「通過瞭解小麥基因組構成及其多樣性，我們能夠更好地告訴種植者如何來提高產量，尤其是如何在小麥易於遇到疾病和乾旱的地區提高產量。很明顯，我們越早做到這一點越好，而DRAGEN能夠幫助我們達成這一目標。」

訊息來源 Edico Genome