爭議多年的醫師課稅問題終於有解！財政部出具解釋令，明確限縮醫師申報執行業務費用，新規定只有醫院負責人或聯合診所個別開業的醫師的所得，可以用「執行業務所得」報稅，扣除2成的執業成本，其餘的醫師屬醫療機構的「雇傭關係」，其所得必須以「薪資所得」報稅，不溯及既往，最快明年5月報稅時醫師就要多繳稅了。

現行醫師「駐診拆帳」課稅規定，自1973年以來已行之多年，但因認定時有爭議，財政部於2001年發布解釋，說明駐診拆帳指醫院與醫師「無僱傭關係」，由醫師提供專業知識與技術，醫院提供護理人員、醫療器材及場所，雙方按駐診收入，依合約所訂拆帳比例給付報酬，並由國稅局依事實認定。

根據規定，醫生的所得性質若為執行業務所得，報稅時可扣除2成必要費用，如今新解釋令出爐，大部分醫師所得性質改為薪資所得後，報稅時只能扣除10.4萬元的薪資特別扣除額，無法以「駐診拆帳」、「合夥」等其他理由，以執行業務所得方式打8折繳稅。

財政部為了補法令漏洞，部長李述德昨昨在卸任前夕簽核相關解釋令，未來不論是像長庚等大型教學醫院，或是一般合資診所，只要不是衛生署登記的負責人，都將以薪資所得課稅。