不管就地理位置或貿易交流而言，台灣是菲律賓主要出口目的地，更是投資的重要來源，雖菲律賓謹守「一個中國政策」，但在近來兩岸關係穩定，台灣和新加坡即將商簽FTA，而菲律賓也把台灣視為重要的貿易夥伴，因此，台灣也將鎖定菲律賓為下一個FTA目標選單。
《中央日報》刊載，菲律賓有迫切的經濟理由，與台灣促成更緊密的經貿關係。菲律賓前貿工部長拉浦斯（Jesli A. Lapus）曾明示，菲國希望把現有的「高雄-蘇比克灣-克拉克經濟走廊」合作備忘錄，升級到全國性的FTA層次。
近來，菲律賓前全國經濟發展局（NEDA）局長桑托斯（Augusto B. Santos）證實，該局已透過附屬的菲律賓發展研究院，研究未來與台簽署 FTA 的可能性。
現階段，台灣啟動 FTA 小組對亞太國家展開積極商談，並期能在2年內完成第二個確認洽簽 FTA 的國家。
中華民國駐菲代表處現正與艾奎諾3世政府的經貿團隊討論 FTA 洽簽事宜，但表示暫時不便透露進展。
